Sciences & technologie. C, Biotechnologies
Volume 0, Numéro 34, Pages 24-31
2011-12-31
Contribution Du Diagnostic Biochimique Bacterien Dans L’etablissement Des Parentes Phylogenetiques : Cas Des Enterobacteriaceae Et Pseudomonas Sp.
Auteurs : Hamidechi M. A . Meziani M .
Résumé
Dix souches bactériennes ont été isolées à partir des prélèvements cliniques fournies par le laboratoire de bactériologie (Daksi, Constantine). Parmi les dix souches étudiées, huit appartiennent à la famille des Enterobacteriaceae et deux font partie des Pseudomonadaceae. Ces souches ont été identifiées présomptivement selon leurs caractères biochimiques, leur sensibilité ou leur résistance aux antibiotiques, et leur taux d’azote total mesuré par la méthode Kjeldahl. Un profil phylogénétique a été réalisé par les méthodes phénétiques basées sur le calcul de distances génétiques, en utilisant l’algorithme du Neighbor Joining (NJ) et l’analyse bioinformatique des séquences de l’ARNr 16S en vue de comparer les deux phylogénies (phénotypique et génotypique). L’analyse des topologies obtenues a permis de montrer que le phénotype biochimique présente certaines limites dans l’identification bactérienne et que l’analyse des séquences de l’ARNr 16S est un outil déterminant dans l’identification bactérienne à l’échelle de l’espèce.
Mots clés
Enterobacteriaceae, Pseudomonadaceae, phénotype, phylogénie.
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